Mesto Malacky je zriaďovateľom troch základných škôl: ZŠ Dr. J. Dérera, ZŠ Štúrova a ZŠ Záhorácka.  Pre tieto školy určuje školské obvody. Zriaďovateľom Spojenej školy sv. Františka Assiského je Bratislavská arcidiecéza rímskokatolíckej cirkvi, na ňu sa preto mestské školské obvody nevzťahujú. Do tejto školy je možné zapísať dieťa bez ohľadu na jeho zaradenie do školského obvodu.

V septembri 2020 sa bude v Malackách otvárať 12 prváckych tried s kapacitou 264 detí. ZŠ Dr. J. Dérera a ZŠ Štúrova otvoria po 3 triedy a ZŠ Záhorácka otvorí 4 triedy. Cirkevná ZŠ bude mať 2 triedy.
 
•    ZŠ Dr. J. Dérera
Bernolákova, Boženy Nemcovej, Budovateľská, Duklianskych hrdinov, Džbankáreň, Ferdiša Kostku, gen. M. R. Štefánika, Hlboká, Hodžova, Hurbanova, Jána Hollého, Jána Kalinčiaka, Janka Kráľa, Jánošíkova – v časti od Veľkomoravskej po Kalista Orgoňa, Kláštorné námestie, Legionárska, Lesná, Ľuda Zúbka, Mierové námestie, Mojmírova, Na brehu, Na majeri, Nad výhonom, Nádražná, Námestie SNP, Oslobodenia, Partizánska, Pavla Blahu, Petra Jilemnického, Písniky, Príjazdná, Radlinského, Rakárenská, Rastislavova, Robotnícka, Rudolfa Dilonga, Sama Chalupku, Svätoplukova, Štefana Čulena, Táborisko, Tichá, Ulica Karola Virsíka, Veľkomoravská – v časti od gen. M. R. Štefánika po Jána Hollého, Vlastenecká, Vysoká, Zámocká, lokalita záhradkárskej osady Rádek V.

•    ZŠ Štúrova
Agátová, Alojza Veselého, arm. gen. L. Svobodu, Boreckého, Brezová, Dielenská, D. Skuteckého, Dubovského, F. Malovaného, Gaštanová, Jánošíkova – v časti od Kalista Orgoňa po ulicu Pri Maline, Javorová, Jelšová, Jesenského, Jozefa Gabčíka, Jozefa Murgaša, Kalista Orgoňa, kpt. Miloša Uhra, Lipová, L. Novomeského, Ľ. Kukorelliho, Ľudovíta Fullu, Michala Tillnera, Ota Kožucha, Pezinská, Pri Maline, Priemyselná, Sadová, Stromová, Stupavská, Štúrova, Továrenská, V. Clementisa, Záhradná, lokalita záhradkárskej osady Olšiny.

•    ZŠ Záhorácka
1. mája, Brnianska, Břeclavská, Cesta mládeže, Družstevná, Hviezdoslavova, Ivana Dérera, Jána Kollára, Jozefa Kubinu, Kozia, Kukučínova, Malé námestie, Mansueta Olšovského, Martina Benku, Martina Rázusa, Mirka Nešpora, Mlynská, Nová, Pavla Hallona, Petra Straku, Poľná, Pribinova, Sasinkova, Sládkovičova, Slovenská, Ulica Ernsta Wiesnera, Ulica Ludwiga Angerera, Vajanského, Veľkomoravská – v časti od Jána Hollého smerom na Cestu mládeže, Vendelína J. Kučeru, Vinohrádok, Vševlada Gajdoša, Záhorácka, lokalita záhradkárskej osady Prídavky, územie obce Kostolište, územie obce Suchohrad.

•    Spojená škola sv. Františka Assiského
Do tejto školy je možné zapísať dieťa bez ohľadu na jeho zaradenie do školského obvodu.

-red-