Malacky v rozličných obdobiach používali rôzne modifikácie erbu, ktorý sa postupne vyvíjal až do súčasnej podoby. Podľa interpretácie popredného heraldika a genealóga prof. Jozefa Nováka predlohou erbu je pečatidlo z roku 1577.
S otázkou erbu je úzko spätá aj otázka vzniku názvu mesta, ktorá je však sporná a v súvislosti s ňou je známych niekoľko teórií:
Jedna z teórií hovorí o súvislosti názvu Malacky s maďarským slovom "malac" - svinka, resp. "malacka“ – prasiatko. V okolí sa totiž nachádzalo množstvo diviakov a konalo sa tu veľa poľovačiek.
Druhá teória odvodzuje názov Malacky od slova "mláky" a vychádza z toho, že na pôde mesta boli kedysi rozsiahle močariská. Osadu, ktorá na tomto mieste vznikla, si ľud nazval "Mláky", z čoho neskôr vzniklo pomenovanie dnešných Malaciek.
Podľa tretej teórie súvislosť pomenovania mesta by sa mohla hľadať i medzi názvom obce z najstarších prameňov (Moluchka) a medzi názvom potoka Malina. Za zmienku stojí i teória spomínaná v Spolku záhorských akademikov (SZA) v roku 1942, podľa ktorej sa vyskytoval aj názov "Mlaky" ako názov miesta, kde sa mlátilo. Lingvistický výskum ju dokonca uprednostňuje (prof.. J. Ondruš).
Erb mesta Malacky tvorí v modrom štíte pod strieborným kaštieľom a zeleným stromom bežiaci strieborný diviak. Erb mesta je zaregistrovaný v heraldickom registri Slovenskej republiky.
Použiť erb mesta je možné len na základe súhlasu primátora. Žiadateľ o použitie erbu mesta predloží primátorovi písomnú žiadosť, ktorá musí obsahovať:
Erb mesta na stiahnutie: